1，发病情况复杂，常见病大规模发生，流行
随着苗种在全国范围频繁互换，疾病的多样性增加，发病时间也由传统的春夏或夏秋两季发病高峰逐渐向全年过度。之前，有些鱼病只在特定地区发生，而现在疾病已经发展成全国性的。危害程度越来越严重，危害品种越来越多。
传统的养殖品种：青，草，鲢，鳙，鲤，鲫，鳊等鱼，其病害严重，最常见的疾病如草鱼的出血，细菌性疾病及主要淡水鱼类的出血性败血症等。
2，多种疾病在同一养殖对象呈并发趋势。
多种疾病并发比单一疾病更为常见。常规养殖中鱼类疾病常常出现寄生虫并发细菌性疾病，多种细菌性疾病混合感染，以及与病*性疾病，真菌性疾病混合感染，多种疾病并发已成为一种常态。例如：鱼类烂鳃烂身病大多是细菌性疾病，但常与车轮虫，指环虫并发，低温期又常伴有鳃霉病和水霉病的发生，有时也与赤皮病，肠炎，肝胆综合征并发，再加上水质不良，气候突变，进一步加大了治疗难度和用药成本。多种疾病的并发需要养殖人员多留意多观察及时询问技术人员，抓住问题的核心，明确科学的处方及用药程序，配方用药，从而达到降低死亡，快速治愈，降低用药成本。
3，环境胁迫导致疾病的发生呈明显的上升态势
水产养殖的疾病不仅表现在病原性疾病发生加剧，更表现在环境胁迫引起的疾病发生加剧。尤其是夏季由于水质营养化引起鱼体抵抗力下降，藻类暴发，细菌，寄生虫滋生，鱼病频发。鱼病诊断中经常发现蓝藻，红水，黑水，白水，等不良水质，一方面是由投入品《饵料，药物等》造成的污染，导致水质恶化，严重是引起氨氮及亚硝酸盐中*等。
4，重大疫病暴发流行
在疾病高暴期，致死率高，每年因病*出血而导致的死亡率高达95%以上，罗非鱼链球菌病成为顽疾，淡水鱼类细菌性败血症，死亡率高达95%以上，特色养殖品种鳜鱼传染性脾肾坏死病*病，*颡鱼爱德华氏菌病，鳗狂游病，乌鳢诺卡氏菌病等，感染死亡率可达80%~90%,显然疾病问题完全影响了养殖业的发展
5，新疾病不断出现，不明疾病危害不时发生
近些年来，大量养殖不断增加，如*鳝、*颡鱼、鲟鱼、小龙虾、河蟹、鳜鱼、罗非鱼、大鲵、冷水性鱼类、海水鱼类、海水甲壳动物与软体动物等，其养殖规模在不断扩大，而新养殖对象的新疾病也在不断出现。据研究，这些新养殖对象都可被多种病原生物感染，导致严重的疾病发生。例如，池塘或稻田养殖的小龙虾，已经发现其可以被对虾病*感染，并造成大规模的死亡。鲫鱼的病害问题更是如此，近些年，鲜鱼养殖业随着其苗种繁育技术及养殖技术的成熟而发展迅猛。据中国水产科学研究调查，鲟鱼易患多种细菌性疾病，并且有些病因或病原尚不明了，整体发病率不低于60%，死亡率超过50%，严重制约了鲟鱼养殖产业的发展，造成重大经济损失。
不明疾病对水产养殖的危害不时发生。只能说过去偶然发生过，也被确诊过，并进行了较深入的研究，但因危害不大而未被引起重视。随着水产养殖业的迅猛发展，“不明疾病”对水产养殖生物的危害性迅速加重，如鲫鱼的红病、*颗鱼的裂头综合征、鲤鱼的坏鲤死亡症、乌鳢的诺卡氏菌病、罗非鱼的链球菌病等在近几年都给水产养殖业带来很大的危害，尽管很多学者已经分离出了病原微生物，但从临床表现与治疗看，大多数不是由单一病原引起的，而且治疗该类疾病药物的开发远没有跟上疾病的变化，现在大都采用以水质改良、口服药物、提高抗病力为主的综合办法，但治疗效果常常不尽如人意。
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