湖南白癜风医院 http://pf.39.net/bdfyy/bdflx/140322/4358927.html输血性败血症是在输血过程中引入病原感染引起的一类疾病，是控制院内感染的一项严峻挑战。目前败血症输血事件的调查受限于常规细菌培养方法的耗时及预先抗生素治疗导致的微生物含量低等。本研究发表在SCI微生物组学领域TOP期刊《ClinicalInfectiousDiseases》（IF=5.9）上，报道了3例mNGS技术在输血性败血症检测中的应用，并与常规培养结果进行了比较。研究发现，直接临床血液标本的mNGS结果可以精确地检测到导致每个输血性败血症病例的病原体；在每个病例中对病原体总量的纵向评估阐释了输血传播感染相关事件的时间序列；无法培养或者因之前使用抗生素而无法生长的血小板产品残留和血液标本残留都可以通过不依赖培养的mNGS技术获得信息数据。
◆研究背景
过去的50年里，虽然全球范围内输血相关的感染在下降，但是血小板产品的细菌污染仍然是一个重大的公共卫生挑战，大约-个单位中就有一个可检出微生物。这是因为与血液制品相比，常温保存的血小板更容易滋生病菌，皮肤菌群、无症状菌血病供者以及直接的环境接触是污染的主要来源。十多年来，西方国家广泛使用amotosalen（紫外线照射激活的核酸交联剂）减少血小板制品中的病原体，并且该方法近期也得到了美国FDA的认可。本研究对3个输血相关的败血症病例进行了描述，其中包含一例降病原体处理血小板产品。对于每一个案例，除了标准的微生物诊断外，还进行了mNGS测序，并发现mNGS能够对细菌分离株进行快速和精确的分类鉴定和系统发育分析，以及对直接临床样本进行不依赖培养评估。
◆研究方法
1、研究患者：3例4个输血感染导致坏血症的患者，其中两个患者的病原来自同一个供者。2、研究方法：1）血液、血小板输液残留和红血细胞残留进行有氧和厌氧的培养（BD）；MALDI-TOF用于物种鉴定（Bruker）。2）每个样本10-ngDNA经酶切后建库；使用IlluminaMiSeq或NextSeq进行mNGS测序。3）生信分析部分，基于reads的分析使用IDseq流程进行分类鉴定和丰度测定；基因组组装采用Unicycler，并使用PATRIC进行注释。Snippy用于组装序列的比对，之后使用bcftools软件得到SNP，然后使用RAxML构建系统发育树。
◆研究结果
1、研究1：血小板输血造成不动杆菌（Acinetobacter）感染败血症
病人A，59岁男性，复发性急性淋巴细胞白血病化疗，计划出院当天给予2剂降病原体处理血小板。第一剂完成时并无副作用，但完成第二剂两小时后患者出现寒战和僵硬并伴随发烧和严重低血压。在被转移到重症监护室之前，接受了补液和万古霉素治疗，并接受了美罗培南、血管升压药、呼吸支持和持续肾替代治疗。16天后完全康复出院，并接受肠道外抗生素治疗。
患者输血后4.5小时的血液最终培养结果为Acinetobactercalcoaceticus/baumannii(ACB)
